
产品货号:F7519S
储存条件:-20℃,有效期两年

组分 | 规格 |
ApeKI(10 U/ul) | 50 ul |
10×Cut Buffer C | 1 ml |
产品简介
ApeKI来源于超嗜热需氧古生菌(Aeropyrum pernix) K1,属于Type IIP型限制酶,识别并切割G/CWGC序列,形成3碱基突出的粘性末端。ApeKI是基因组简化测序(genotyping-by-sequencing,GBS)的首选酶之一,此外,还广泛应用于动植物遗传研究、群体进化分析及功能基因定位等领域。
建议反应条件:1×Cut Buffer C;75℃温育;参照“DNA 酶切流程”配制反应体系。本品在37℃进行酶切反应时,有<10%的活性。
失活条件:不可热失活,请使用酚氯仿抽提或柱纯化。
活性定义:1 活性单位 (U) 是指在 50 μl 反应体系中,75℃ 1 h内完全酶切 1 µg λDNA 所需的酶量。
质量控制
75℃下,10 U ApeKI能够在15 min内完全消化1ug λDNA。
75℃下,将10 U ApeKI与1 μg λDNA共同温育3 h,未检测到其他核酸酶污染或星号活性引起的底物非特异性降解。延时酶切可能出现星号活性。
75℃下,使用10 U ApeKI消化底物,回收酶切产物。在22℃下使用适量 T4 DNA Ligase (Fast)可以将酶切产物重新连接。将连接产物再次回收后,使用相同的内切酶可以重新切开连接产物。
使用方法
1.DNA 快速酶切流程
(1)在冰上按如下建议的加样顺序配制反应体系:
ddH2O | Up to 50 ul |
10×Cut Buffer C | 5 ul |
底物 DNAa | 1 ug |
ApeKI(10 U/ul) | 1 ul |
Total | 50 ul |
a. DNA 底物中应不含苯酚、氯仿、乙醇、EDTA、洗涤剂或高浓度盐,否则将会影响ApeKI酶活性。
(2)轻柔吸打或轻弹管壁以混匀(切勿涡旋),然后瞬时离心以收集挂壁液滴;
(3)75℃温育 15min~3h;
(4)通过吸附柱或苯酚/氯仿纯化终止反应(可选)。
2. 注意事项
① 反应体系中加入的酶体积不应超过总体积的10%,避免酶中过多的甘油引起星号活性;
② 限制性内切酶存储缓冲液中的添加剂(例如甘油、盐)与底物溶液中的污染物(例如盐、EDTA 或乙醇等)相同,反应体积越小,酶切
反应抑制效应越强。
不同 DNA 中的酶切位点数量
λDNA | ΦX174 | pBR322 | pUC57 | pUC18/19 | SV40 | M13mp18/19 | Adeno2 |
199 | 14 | 21 | 12 | 12 | 22 | 10 | 179 |
甲基化修饰影响
Dam | Dcm | CpG | EcoKI | EcoBI |
无影响 | 无影响 | 剪切受阻 | 无影响 | 无影响 |
在不同反应缓冲液中的活性
LabFD™ Buffer | Thermo Scientific FastDigest Buffer | NEB CutSmart®Buffer | Takara QuickCut™Buffer | |
活性 | 12.5% | 50% | 12.5% | 25% |
注:活性数据来自 LABLEAD 限制酶标准反应体系下的检测。