货号:N30210
存储条件:4-30°C,有效期5年
产品说明
LABLEAD Ni-NTA Beads 6FF 属于一类金属螯合介质,以高流速琼脂糖为基质,以次氮基三乙酸(NTA)或亚氨基二乙酸(1DA)为配基,并螯合金属离子Ni2+而形成的一种亲和层析介质。该亲和介质不仅具有吸附容量大、选择性好、分辨率高、超低限度的Ni2+泄露、易于再生、成本低等优点,还有利于保持产品的生物活性和提高产品的收率,从而广泛用于生物制药和生物工程下游蛋白质、核酸及多肽的分离纯化,尤其是组氨酸标记蛋白质的高效制备。
产品指标
产品名称 | Ni-NTA Beads 6FF |
配基 | 次氮基三乙酸(NTA) |
基质 | 6%高度交联琼脂糖 |
粒径 | 45μm-165μm |
载量(ml) | 40mg His标签蛋白 |
螯合量 | 25μmol/ml |
推荐流速 | 150~15000px/h |
最大耐压 | 0.3MPa |
pH稳定性 | 3~12(工作) 2~14(清洗) |
化学稳定性 | 40°C放置一周:0.01MHcl,0.1MNaOH; 12h:1MNaOH,70%乙酸; 1h:2% SDS; 30min:30%异丙醇 |
纯化流程
纯化用Buffer 可使用参考下表中推荐 Buffer,也可根据自己的使用习惯配置不同的缓冲液体系,基本原理是低咪唑上样,高咪唑洗脱,或者高pH上样,低 pH洗脱。Buffer 在使用前最好用0.22μm 或者 0.45μm滤膜过滤除菌。Ni-NTA Beads FF可以用于可溶蛋白和包涵体蛋白的纯化,两种方法所需 Buffer 不同,配置方法见下表:
表1:可溶性蛋白纯化所需缓冲液及配方:
名称 | 体积 | 配方 |
Lysis Buffer | 1L | 50 mM NaH2PO4(7.80 g NaH2PO4·2H2O) 300 mM NaCl(17.54 g NaCl) 10 mM imidazole(0.68 g imidazole) 使用 NaOH 溶液调节 pH 至 8.0,使用 0.22 或者 0.45 μm 滤膜过滤除菌。 |
Wash Buffer | 1L | 50 mM NaH2PO4(7.80 g NaH2PO4·2H2O) 300 mM NaCl(17.54 g NaCl) 20 mM imidazole(1.36 g imidazole) 使用 NaOH 溶液调节 pH 至 8.0,使用 0.22 或者 0.45 μm 滤膜过滤除菌。 |
Elution Buffer | 1L | 50 mM NaH2PO4(7.80 g NaH2PO4·2H2O) 300 mM NaCl(17.54 g NaCl) 250 mM imidazole(17.0 g imidazole) 使用 NaOH溶液调节 pH 至 8.0,使用 0.22 或者 0.45 μm 滤膜过滤除菌。 |
表2:酸洗脱方式,包涵体蛋白纯化所需缓冲液及配方:
名称 | 体积 | 配方 |
Lysis Buffer | 1L | 8 M Urea(480.50 g urea) 100 mM NaH2PO4(15.60 g NaH2PO4·2H2O) 100 mM Tris·HCl (15.76 g Tris·HCl) 使用盐酸溶液调节 pH 至 8.0,使用 0.22 或者 0.45 μm 滤膜过滤除菌。 |
Wash Buffer | 1L | 8 M Urea(480.50 g urea ) 100 mM NaH2PO4(15.60 g NaH2PO4·2H2O) 100 mM Tris·HCl(15.76 g Tris·HCl) 使用盐酸溶液调节 pH至 6.3,使用 0.22 或者 0.45 μm 滤膜过滤除菌。 |
Elution Buffer | 1L | 8 M Urea(480.50 g urea) 100 mM NaH2PO4(15.60 g NaH2PO4·2H2O) 100 mM Tris·Cl(15.76 g Tris·Cl) 使用盐酸溶液调节 pH 至 4.5,使用 0.22 或者 0.45 μm 滤膜过滤除菌。 |
表3:咪唑洗脱,包涵体蛋白纯化所需缓冲液及配方:
名称 | 体积 | 配方 |
Lysis Buffer | 1L | 8 M Urea(480.50 g urea) 50 mM NaH2PO4(7.8 g NaH2PO4·2H2O) 300 mM NaCl(17.54 gNaCl) 10 mM Imidazole(0.68 g imidazole) 使用盐酸溶液调节 pH至8.0,使用 0.22或者 0.45 μm 滤膜过滤除菌。 |
Wash Buffer | 1L | 8 M Urea(480.50 g urea ) 50 mM NaH2PO4(7.8 g NaH2PO4·2H2O) 300 mM NaCl(17.54 gNaCl) 20 mM Imidazole(1.36 g imidazole) 使用盐酸溶液调节 pH至8.0,使用 0.22 或者 0.45 μm 滤膜过滤除菌。 |
Elution Buffer | 1L | 8 M Urea(480.50 g urea) 50 mM NaH2PO4(7.8 g NaH2PO4·2H2O) 300 mM NaCl(17.54 gNaCl) 250 mM Imidazole(17 g imidazole) 使用盐酸溶液调节 pH 至 8.0,使用 0.22 或者 0.45 μm 滤膜过滤除菌。 |
1.样品准备
1.1 细菌或酵母表达的蛋白
1.1.1 挑取单菌落到 LB 培养基中,根据载体使用说明加入相应浓度的诱导剂诱导相应的时间。
1.1.2 表达结束后,将培养液转移到离心杯中,7,000rpm,离心 15min 收集菌体,然后加入1/10 体积的 Lysis Buffer 和 PMSF,PMSF在破碎前加入,最终浓度为1mM。加入溶菌酶,工作浓度为0.2-0.4mg/ml)
注:如果表达的宿主细胞内含pLysS 或pLysE,可以不加溶菌酶,同时也可加入其他蛋白酶抑制剂,但不能影响目的蛋白与树脂的结合。
1.1.3 将菌体沉淀悬浮起来,如果菌液浓度高,也可考虑加入10μg/ml RNase A 和5μg/ml DNase I),混匀,放置于冰上,然后冰上超声破碎细胞,至菌液基本保持澄清。
1.1.4将澄清的破碎液转移至离心管中,10,000rpm 下,4 度离心20-30 分钟。取上清,置于冰上备用或-20度保存。
1.2 酵母、昆虫和哺乳细胞分泌表达可溶性蛋白
1.2.1 将细胞培养液转移至离心杯,5000rpm 下,离心10min,收集菌体得上清,如上清中不含 EDTA、组氨酸和还原剂等物质,即可直接加入柱子使用;如含有 EDTA、组氨酸和还原剂等物质,需用 Lysis buffer 透析后才能加入柱子。
1.2.2 对于大量体积的上清,需加入硫酸氨沉淀浓缩后,蛋白还需用 Lysis buffer透析后才能加入柱子。
1.3 包涵体蛋白纯化(变性条件)
1.3.1 将培养液转移到离心杯中,7000rpm(7500xg),离心15min 收集菌体,去掉上清。
1.3.2 按照菌体:Lysis buffer(不含8 M尿素)=1:10(W/V)将菌体悬浮起来,混匀,冰浴超声破碎。
1.3.3 将破碎液转移至离心管中,10000rpm下,4℃ 离心 20-30min。去掉上清,步骤 1.3.2和 1.3.3可以重复一次。
1.3.4 按照菌体:Lysis buffer(含 8M 尿素)=1:10(W/V)将包涵体悬浮起来。
1.3.5 变性条件下进行 His 标签蛋白纯化,具体缓冲液配方见表2、表3。
2. Ni NTA Beads 6FF 的装填
2.1 重力柱的装填
(1)取合适规格的重力层析柱,装入下垫片,加入适量纯水润洗柱管和垫片,关闭下出口。
(2)将Ni NTA Beads 6FF混合均匀,用枪头吸取适量浆液加入至重力柱中(填料实际体积占悬液的一半),打开下出口流干保护液。
(3)加入适量纯水冲洗介质,待柱管中液体重力流干后,关闭下出口。
(4)装入润洗后的上垫片,确保垫片与填料之前无空隙,且保持水平。
(5)装填好的重力柱可以直接加入平衡液进行平衡,暂不使用时则加入保护液,4-30°C保存。
装柱前根据层析柱直径计算柱子底面积,根据所需装柱高度计算所需介质体积,公式如下:
V=1.15πr2h
V:所需介质体积ml
1.15:压缩系数
r:柱管半径cm
h:装填高度cm
3.样品纯化
3.1 孵育法纯化
3.1.1 根据纯化的样品量,取适量Ni-NTABeads 6FF加入离心管中,1000rpm离心1min,吸弃上清;也可加入重力柱中,流干保护液。
3.1.2 向离心管中加入5倍介质体积的Lysis Buffer清洗介质,1000rpm离心1min,吸弃上清;如使用重力柱,则直接在重力柱中清洗,直接重力流干Lysis Buffer;重复两次以上。
3.1.3 加入样品,封闭离心管或重力柱管,4°C振荡孵育2-4h或者37°C孵育30min-2h。
3.1.4 孵育结束后,1000rpm离心1min,吸弃上清,或过滤收集介质,上清保留作为流穿,用于电泳鉴定。
3.1.5 用5倍介质体积的Wash Buffer清洗介质,1000 rpm离心1 min 或重力柱管过滤,去除上清(注意不要吸到介质),重复3-5次,中间建议更换新离心管。必要时可以调整咪唑的浓度进行洗杂。
3.1.6 加入3-5倍柱体积的Elution Buffer进行洗脱,室温孵育10-15 min,1000 rpm离心1min或重力柱管收集洗脱液,可重复2-3次。
3.2 重力柱法纯化
3.2.1 将装填好的 Ni-NTA Beads 6FF重力柱用5倍柱体积Lysis Buffer进行平衡,使填料处于与目的蛋白相同的缓冲液体系下,重复2-3次。
3.2.2 将样品加到平衡好的重力柱中,样品保留时间至少2min,保证样品和介质充分接触,收集流出液,可以反复上样增加结合效率。
3.2.3 用10-15倍柱体积的Wash Buffer进行洗杂,去除非特异性吸附的杂蛋白,收集洗杂液。必要时可以调整咪唑的浓度进行洗杂。
3.2.4使用5-10倍柱体积的Elution Buffer洗脱,分段收集,每一个柱体积收集一管,分别检测,既可保证所有结合的目的蛋白被洗脱,又
可得到高纯度和高浓度的蛋白。
3.3 中压层析柱法纯化
Ni-NTA Beads 6FF装填好后,可以用各种常规的中压色谱系统,以ÄKTA 仪器使用为例介绍其使用方法。
3.3.1 将泵管道中注满去离子水。去掉上塞子,将层析柱连接至色谱系统中,打开下出口,将预装柱接到色谱系统中,并旋紧。
3.3.2 用 3-5 倍柱体积的去离子水冲洗出储存缓冲液。
3.3.3 使用至少 5 倍柱床体积的 Lysis Buffer 平衡色谱柱。
3.3.4 利用泵或注射器上样。
注:样品的粘度增加使得即使上样体积很少,也会导致层析柱很大的反压。上样量不要超过柱子的结合能力。大量的样品体积也可能造成很大的反压,使得进样器更难使用。
3.3.5 用 Wash Buffer 冲洗柱子,直到紫外吸收达到一个稳定的基线(一般至少10-15个柱体积)。
注:在样品和结合缓冲液中加入咪唑可以提高样品纯度。
3.3.6 用 Elution Buffer 采用一步法或线性梯度洗脱。一步洗脱中,通常 5 倍柱体积洗脱液就足够了。可以用一个小的梯度,例如 20 倍柱体积或更多,来分离不同结合强度的蛋白质。
4. SDS-PAGE 检测
将使用纯化产品得到的样品(包括流出组分、洗杂组分和洗脱组分)以及原始样品使用SDS-PAGE 检测纯化效果。
5. 在位清洗
当填料使用过程中发现反压过高或者填料上面出现明显的污染时,需要进行在位清洗操作(Cleaning-in-Place,CIP)。建议按照下面操作去除填料上残留的污染物,如沉淀蛋白、疏水蛋白和脂蛋白等。
通过使用30%异丙醇清洗 5-10 个柱体积,接触时间为15-20分钟可以去除此类污染物。然后再使用 10 倍柱体积的去离子水清洗。也可以选择使用含有去污剂的酸性或碱性溶液,清洗填料 2倍柱体积。
例如,含有 0.1–0.5% 非离子去污剂的 0.1 M 醋酸溶液,接触时间为 1–2h。去污剂处理后,需要使用70%的乙醇清洗 5 个柱体积,以彻底去除去污剂。最后使用10倍柱体积的去离子水清洗。
使用 1.5M NaCl 溶液接触时间为10-15分钟清洗。然后再使用去离子水清洗10个柱体积。
6. 填料再生
组氨酸标签蛋白亲和纯化填料所带的镍离子不需要经常螯合去除和重新挂镍离子。当填料使用过程中发现颜色变浅,或者填料载量明显变低时,需要进行对填料进行镍离子剥离和重新挂镍离子进行再生。将填料装填在合适的层析柱内,按照下面操作流程进行镍离子剥离和重新挂镍离子。
6.1 使用5倍柱体积去离子水清洗填料;
6.2 使用5倍柱体积100mM EDTA(pH 8.0)剥落镍离子;
6.3 使用10倍柱体积去离子水清洗填料;
6.4 使用0.5MNaOH清洗5倍柱体积,停留10-15min;
6.5 使用去离子水清洗填料,直至pH中性;
6.6 使用3-5倍柱体积100mM NiSO4再生挂镍;
6.7 使用10倍柱体积去离子水清洗;
填料再生后,可以立即使用,如不立即使用,需要将填料悬浮于等体积的20%乙醇中,置于4-30°C保存。
常见问题一:没有收集到目标蛋白
在蛋白纯化过程中,使用洗脱液对填料上的目标蛋白进行洗脱,在收集液中没有检测到目标蛋白。
问题自查 1:蛋白表达情况怎么样? 目标蛋白是否有正常表达?标签是否正常表达且没有被折叠覆盖?
(1)蛋白样品在用填料纯化之前,先跑下 SDS-PAGE 胶并用考马斯亮蓝染色,如果能看到比较清晰且较粗的目标蛋白条带 ,则表达量较高;
(2)蛋白样品跑 WB,用标签抗体检测,如果能检测到目标条带,则标签有正常表达;
(3)检测蛋白样品中的蛋白浓度,并结合 SDS-PAGE 显示的目标蛋白的占比,可以估算出目标蛋白的表达量;
(4)或者也可以考虑在目标蛋白同时加上 GFP 等荧光标记,通过荧光检测得到蛋白表达量;
(5)如果蛋白上清液中没有检测到蛋白 ,且在沉淀中有大量蛋白 ,此时可能是蛋白形成了包涵体
优化方案:如果蛋白表达量不高,需要对前期质粒构建和蛋白表达过程进行优化。例如更换表达载体,更换标签,进行密码子优化,筛选大肠杆菌培养温度和时间,筛选诱导剂(如IPTG)浓度 ,诱导温度和时间等;
问题自查 2: 目标蛋白到哪里去了? 是没有结合在柱子上 ,还是在柱子上没有洗脱下来?
同时收集上样和洗杂时的流穿液以及洗脱目标蛋白时的洗脱液,如果流穿液中有大量的目标蛋白 ,则表示目标蛋白没有和填料有效结合;如果流穿液和洗脱液中都没有目标蛋白,则表示目标蛋白可能还结合在柱子上 ,没有洗脱下来;
实验优化一:流穿液中有目标蛋白
His 标签
①样品或结合缓冲液条件不合适 :样品和结合缓冲液中不能含有高浓度的金属螯合剂(例如 EDTA) ,高浓度强还原剂(例如 DTT) ,或者高浓度的咪唑;
②His 标签和填料结合较弱:适当降低上样流速并增加孵育时间;增加 His 标签的数量(6-10 个);
③调整结合缓冲液的 PH 为 7-8 , PH 过低会影响蛋白结合;上样量超出填料载量:使用更大体积的层析柱;
实验优化二: 目标蛋白没有洗脱下来:
His 标签
①洗脱条件过于温和 :适当增加洗脱缓冲液中的咪唑浓度 ,或者尝试降低洗脱液的 PH;增加洗脱步骤和时间;
②目标蛋白与填料发生非特异性结合 :在洗脱缓冲液中加入非离子型去垢剂(例如2% Triton X-100) ,或者增加洗脱液中 NaCl 的浓度
③目标蛋白在填料上发生了沉淀 :减少上样量 ,添加去垢剂或者在变性条件下进行洗脱;
常见问题二:蛋白纯度不高 ,杂带较多
问题描述:收集液中有目标蛋白,但同时也有很多杂蛋白。这种情况一般发生在使用His 标签时, 以下主要对 His 标签蛋白纯化进行讲解。
问题自查 1 是否目标蛋白本身表达不高 ,而杂蛋白表达较高
实验优化 1:按照问题 1 中的方法检测目标蛋白表达;优化质粒构建和蛋白表达的步骤;
问题自查 2 蛋白是否容易降解?
在 SDS-PAGE 胶上观察杂带的分子量;如果杂带的分子量比目标蛋白分子量小,且相差值约为几个结构域或特定酶切位点,说明可能该杂带是由目标蛋白降解产生的。
优化方案:
(1)使用线性洗脱的方式: 500 mM 咪唑 ,0%-100%线性梯度洗脱 10 CV;
(2)漂洗缓冲液中加入少量咪唑;
(3)裂解液和缓冲液中添加去垢剂(2% Triton X-100/Tween 20);或添加甘油(20%以内) ;增加缓冲液中 NaCl 浓度至 500 mM
(4)其他考虑方向包括 His 标签蛋白被部分降解 ,优化结合和洗脱条件 ,尝试不同金属离子螯合的填料,构建双标签蛋白,添加去垢剂,还原剂等添加剂破坏杂质和目的蛋白间
的相互作用等等
(5)在镍柱纯化之后增加离子交换和分子筛等步骤继续纯化;
常见问题三:填料变色
(1)镍柱变白 :如果上样量较大 ,镍柱填料可能由于结合了大量的蛋白而呈现发白的现象 ,这是正常的;
但如果缓冲液中存在螯合剂如 EDTA 等 ,可能导致镍离子从柱上脱落而发白 ,并且导致目的蛋白的结合量降低;
(2)镍柱出现棕色 :这主要是缓冲液中还原剂的影响。在常规的填料中存在的游离镍离子 ,可能会被 DTT 还原生成棕色的沉淀。
(3)杂质与目的蛋白有相互作用 :加入去垢剂、还原剂、甘油等破坏杂蛋白与目的蛋白之间的相互作用 ,或者尝试调整缓冲液的盐浓度。
常见问题四:柱子堵了
问题描述:柱子发生堵塞,流速降低,压力增高;此时需要根据说明书对层析柱进行清洗。
问题自查 1 样品和缓冲液上样前有没有过滤?
实验优化 1 :收集到蛋白样品之后,建议先用超声破碎,然后离心取上清,然后使用0.45um 或者 0.2um 的滤膜进行过滤;
问题自查 2 是否样品浓度或者粘性过高?
实验优化 2 :可以适当稀释样品;如果样品粘性比较高,也可能是样品中含有高浓度的宿主核酸,可以增加超声时间,或者加入核酸酶(5 ug/ml DNase1, 1 mM Mg2+)进行处理。
问题自查 3 层析柱有没有定期清洗?
实验优化 3 :层析柱在使用 5-10 次之后,建议对层析柱进行清洗。清洗方法可以参考说明
常见问题五:填料应该如何清洁再生?
His 标签
常规清洗:可使用 5-10 倍柱体积的纯水或者漂洗缓冲溶液对柱子进行清洗。
当填料在使用过程中发现反压过高或者填料上出现明显污染,需要进行在位清洗(CIP)操作。
N30210/N30230 填料在位清洗前需先去除镍离子,(不脱镍直接上碱洗可能会产生棕色沉淀导致柱子堵塞) ;为了避免不同样品间的相互干扰,或者当介质污染比较严重时(反压增加) ,需要对介质进行在位清洗。在位清洗前,需要预先除去介质上螯合的金属离子(见再生操作) 。在位清洗时,可采用反向冲洗的方法。
1)对于以离子键结合的蛋白,可用 2~3CV 以上的 2M NaCl 清洗,
2)对沉淀蛋白、以疏水性结合的蛋白或脂蛋白,可用 1MNaOH 清洗(1~2h),并用 3~10CV平衡液和 3 CV 以上的纯水冲洗。
3)对疏水性结合的蛋白、脂蛋白和脂类物质,可用 5~10CV 的 70%乙醇或 30%异丙醇清洗(20min 以上) ,并用 3~10CV 的纯水冲洗。
此外,也可用2CV 含去污剂的碱性或酸性溶液清洗。如用 0.1~0.5%的非离子去污剂+0. 1M乙酸冲洗 1~2h ,并用 5~10CV 的 70%乙醇冲洗去除去污剂,然后用 3~10CV 的纯水冲洗。
N30250 填料可直接进行在位清洗
当填料在使用过程中发现反压过高或者填料上出现明显污染,需要进行在位清洗操作。
1) 去除强疏水性结合的蛋白、脂蛋白和脂类
方法一:使用 30%异丙醇清洗 5~10CV ,接触时间为 15~20min 可以去除此类污染物,再用10CV 的纯水清洗;
方法二:使用 0.3M 或 0.5M NaOH 溶液冲洗填料 3CV ,然后用 10-15CV 的纯水清洗。
2)去除离子作用结合的蛋白
使用 1.5M NaCI 溶液清洗 10~ 15min ,再用 10CV 纯水清洗,清洗好
的柱子用 2CV 的 20%乙醇冲洗,置于 2~8°C 保存。
常见问题六:摇菌 250ml ,用填料纯化最少需要几毫升?
常规来说 250ml 菌液可以摇出 1g 左右菌泥,重悬破碎体积为 10ml 左右,大约用 0.5-1ml左右的填料就够了,填料载量是 XX mg/ml 左右。
也和客户的蛋白表达量有很大关系,如果客户的蛋白表达量明显偏低或偏高的话,填料量是需要对应减少或增加的。客户可以破碎后先跑个电泳看下大致表达情况。
常见问题七:标签蛋白纯化试剂盒的缓冲液组分是什么?
H1032/H1035 试剂盒配方
裂解液:ripa 中
结合缓冲液:ripa 中(50mM Tris(pH 7.4),150mM NaCl,1% NP-40,0.5% sodium deoxycholate, 0.1% SDS 等)
漂洗缓冲液:20mM 咪唑,0.3M NaCl ,50mM Tris pH7.9
洗脱缓冲液:500mM 咪唑,0.5M NaCl ,50mM Tris pH7.9
常见问题八:标签该如何选择
标签的选择主要是根据蛋白的特点以及对纯度的要求,新手建议可以从 His 标签开始做起。
①His 标签标签小,纯化步骤简便,纯化条件温和,能纯化可溶性/包涵体蛋白,一般不会影响蛋白的功能结构,且可以产出大量的目标蛋白,纯度和其他标签相比略低,如果对纯度不是要求特别高的情况下首选;
②GST 标签洗脱条件温和,有助于保持蛋白功能活性,适合 pull-down 检测,具有很好的线性动态范围,但分子量较大,需要在纯化后去除标签,且不适宜变性环境;
③MBP 标签可以减少目标蛋白的降解,增加蛋白的表达量和稳定性,提高表达产物的水溶性,但标签较大,对蛋白的结构和功能可能会有一定影响;
④Strep 标签能纯化出高纯度的目标蛋白,纯化条件温和,能进行变性条件下的纯化。纯化柱和填料的价格和其他标签相比略高;
