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【干货分享】酵母单杂
来源: | 作者:LABLEAD | 发布时间: 2026-03-17 | 44 次浏览 | 🔊 点击朗读正文 ❚❚ | 分享到:

实验方案:

酵母单杂交系统是一种在酵母细胞内研究蛋白质与DNA相互作用的强大工具。其核心原理是:将待测的“诱饵”DNA序列(顺式作用元件)插入到报告基因(如 HIS3LacZ*AUR1-C* 等)上游,将待测的“猎物”蛋白质与酵母GAL4转录激活结构域(AD)融合表达。如果蛋白质能特异性结合DNA,则会招募AD并激活下游报告基因的转录,从而通过营养缺陷筛选(如-His)、显色反应(X-β-gal)或抗性筛选(金担子素A)来鉴定互作。


主要步骤:

1. 载体构建:构建“诱饵”载体(含报告基因和DNA序列)和“猎物”载体(AD-蛋白质融合表达)。

2. 酵母转化:将两种载体共转化进入合适的酵母报告菌株。

3. 互作筛选:在缺陷培养基或含抗性/显色底物的平板上筛选阳性克隆。

4. 验证与分析:通过梯度筛选、β-半乳糖苷酶活性定量等排除假阳性,确认互作特异性。


一、实验方案(Y1HGold-pAbAi 系统)

1. 载体构建

· 诱饵载体(AbAi-bait):将目标 DNA 序列(如顺式作用元件的 1-3 个串联重复)克隆到 pAbAi 载体(含 Ura3 筛选标记),用于整合到酵母基因组并作为报告载体。

· 猎物载体(AD-prey):将目标转录因子基因克隆到 pGADT7 载体(含 Leu2 筛选标记,表达 GAL4 激活域融合蛋白)。

2. 诱饵载体线性化与酵母转化

1.  BstBI 酶切 pAbAi-bait 载体使其线性化,胶回收纯化。

2. 采用醋酸锂法将线性化质粒转入 Y1HGold 感受态细胞,涂布 SD/-Ura 固体培养基,28℃培养 2-3 天,筛选整合成功的酵母克隆,通过菌落 PCR 鉴定阳性克隆

3. 自激活检测(AbA 浓度梯度筛选)

1. 挑取阳性诱饵酵母克隆,培养至 OD₆₀₀0.2,梯度稀释(1010¹10²10³)。

2. 分别点样于含 0、100、200、500、1000 ng/mL Aureobasidin A(AbA)的 SD/-Ura 平板,28℃培养 2-3 天。

3. 确定能完全抑制诱饵菌株自激活生长的最低 AbA 浓度,用于后续筛选。

4. 猎物载体转化与互作筛选

1. 制备诱饵酵母感受态,将 AD-prey 质粒(或 pGADT7-cDNA 文库)转入,涂布 SD/-Ura/-Leu+AbA(筛选浓度)平板,28℃培养 3-5 天。

2. 挑取阳性克隆,通过梯度稀释点样(SD/-Ura/-Leu+AbA 与对照平板)验证互作特异性。

5. 阳性克隆鉴定与验证

1. 提取阳性克隆中的猎物质粒,转化大肠杆菌,测序鉴定插入的转录因子基因。

2. 回转化验证:将测序正确的质粒重新转入诱饵酵母,再次点样确认互作稳定性,排除假阳性。



二、常用酵母单杂交系统

系统名称

宿主菌株

诱饵载体

猎物载体

报告基因

筛选方式

缺陷培养基

主要用途

Y1HGoldpAbAi 系统

Y1HGold

pAbAi(基因组整合)

pGADT7 / pGADT7Rec

AUR1C

AbA 抗生素筛选(100-1000 ng/mL)

SD/-Ura

SD/-Leu-Ura

cDNA 文库筛选,假阳性低,发文章首选

Y187pHis2 系统

Y187

pHis2(游离质粒)

pGADT7

HIS3

3AT 抑制(1-100 mM)

SD/-Trp-Leu-His

点对点验证,操作快,不用整合

EGY48pLacZi 系统

EGY48

pLacZi / pOP

pB42AD

LacZ

XαGal 显色(40 μg/mL)

SD/-Trp-Ura

SD/-Trp-Ura-His

显色观察,定性直观,适合教学与初筛

YM4271pINT1 系统

YM4271

pINT1HIS3(整合)

pGAD424 / pACT2

HIS3

3AT 抑制(5-50 mM)

SD/-Leu-His

经典筛库系统,老文献常用,稳定性好



三、Y1HGold-pAbAi  系统筛库流程 

 


四、推荐生物试剂与耗材

类别

名称

货号

试剂盒

酵母转化试剂盒

YT0010/YT0015

培养基

SD 基础培养基

Y0006

SD液体培养基

SD/-trp with broth

Y14028101

SD/-Ura with broth

Y14028102

SD/-His with broth

Y14028103

SD/-Leu with broth

Y14028104

SD/-His-Ura with broth

Y14028201

SD/-His-Trp with broth

Y14028202

SD/-Trp-Ura with broth

Y14028206

SD/-Leu-Ura with broth

Y14028207

SD/-Met-Trp with broth

Y14028208

SD/-Leu-Trp with broth

Y14028220

SD/-His-Leu with broth

Y14028221

SD/-Ade-Trp with broth

Y14028223

YPDA 液体 / 固体培养基

BD 242820

SD固体培养基 

SD/-trp with agar

Y24048101

SD/-Ura with agar

Y24048102

SD/-His with agar

Y24048103

SD/-Leu with agar

Y24048104

SD/-His-Ura with agar

Y24048201

SD/-His-Trp with agar

Y24048202

SD/-Trp-Ura with agar

Y24048206

SD/-Leu-Ura with agar

Y24048207

SD/-Met-Trp with agar

Y24048208

SD/-Leu-Trp with agar

Y24048220

SD/-His-Leu with agar

Y24048221

SD/-Ade-Trp with agar

Y24048223

添加剂

X-α-Gal

X0200

3-AT(Y187-pHis2 系统自激活抑制)

A8056-1

鲑鱼精DNA溶液10mg/ml

D1627

Salmon Sperm DNA鲑鱼精DNA

D1626

金担子素 A(AbA)

C060208