耗材类
蛋 白
纯 化
细胞
生物学
分 子
生物学
实验方案:
酵母单杂交系统是一种在酵母细胞内研究蛋白质与DNA相互作用的强大工具。其核心原理是:将待测的“诱饵”DNA序列(顺式作用元件)插入到报告基因(如 HIS3、LacZ、*AUR1-C* 等)上游,将待测的“猎物”蛋白质与酵母GAL4转录激活结构域(AD)融合表达。如果蛋白质能特异性结合DNA,则会招募AD并激活下游报告基因的转录,从而通过营养缺陷筛选(如-His)、显色反应(X-β-gal)或抗性筛选(金担子素A)来鉴定互作。
主要步骤:
1. 载体构建:构建“诱饵”载体(含报告基因和DNA序列)和“猎物”载体(AD-蛋白质融合表达)。
2. 酵母转化:将两种载体共转化进入合适的酵母报告菌株。
3. 互作筛选:在缺陷培养基或含抗性/显色底物的平板上筛选阳性克隆。
4. 验证与分析:通过梯度筛选、β-半乳糖苷酶活性定量等排除假阳性,确认互作特异性。
一、实验方案(Y1HGold-pAbAi 系统)
1. 载体构建
· 诱饵载体(AbAi-bait):将目标 DNA 序列(如顺式作用元件的 1-3 个串联重复)克隆到 pAbAi 载体(含 Ura3 筛选标记),用于整合到酵母基因组并作为报告载体。
· 猎物载体(AD-prey):将目标转录因子基因克隆到 pGADT7 载体(含 Leu2 筛选标记,表达 GAL4 激活域融合蛋白)。
2. 诱饵载体线性化与酵母转化
1. 用 BstBI 酶切 pAbAi-bait 载体使其线性化,胶回收纯化。
2. 采用醋酸锂法将线性化质粒转入 Y1HGold 感受态细胞,涂布 SD/-Ura 固体培养基,28℃培养 2-3 天,筛选整合成功的酵母克隆,通过菌落 PCR 鉴定阳性克隆
3. 自激活检测(AbA 浓度梯度筛选)
1. 挑取阳性诱饵酵母克隆,培养至 OD₆₀₀≈0.2,梯度稀释(10⁰、10⁻¹、10⁻²、10⁻³)。
2. 分别点样于含 0、100、200、500、1000 ng/mL Aureobasidin A(AbA)的 SD/-Ura 平板,28℃培养 2-3 天。
3. 确定能完全抑制诱饵菌株自激活生长的最低 AbA 浓度,用于后续筛选。
4. 猎物载体转化与互作筛选
1. 制备诱饵酵母感受态,将 AD-prey 质粒(或 pGADT7-cDNA 文库)转入,涂布 SD/-Ura/-Leu+AbA(筛选浓度)平板,28℃培养 3-5 天。
2. 挑取阳性克隆,通过梯度稀释点样(SD/-Ura/-Leu+AbA 与对照平板)验证互作特异性。
5. 阳性克隆鉴定与验证
1. 提取阳性克隆中的猎物质粒,转化大肠杆菌,测序鉴定插入的转录因子基因。
2. 回转化验证:将测序正确的质粒重新转入诱饵酵母,再次点样确认互作稳定性,排除假阳性。
二、常用酵母单杂交系统
系统名称
宿主菌株
诱饵载体
猎物载体
报告基因
筛选方式
缺陷培养基
主要用途
Y1HGoldpAbAi 系统
Y1HGold
pAbAi(基因组整合)
pGADT7 / pGADT7Rec
AUR1C
AbA 抗生素筛选(100-1000 ng/mL)
SD/-Ura
SD/-Leu-Ura
cDNA 文库筛选,假阳性低,发文章首选
Y187pHis2 系统
Y187
pHis2(游离质粒)
pGADT7
HIS3
3AT 抑制(1-100 mM)
SD/-Trp-Leu-His
点对点验证,操作快,不用整合
EGY48pLacZi 系统
EGY48
pLacZi / pOP
pB42AD
LacZ
XαGal 显色(40 μg/mL)
SD/-Trp-Ura
SD/-Trp-Ura-His
显色观察,定性直观,适合教学与初筛
YM4271pINT1 系统
YM4271
pINT1HIS3(整合)
pGAD424 / pACT2
HIS3
3AT 抑制(5-50 mM)
SD/-Leu-His
经典筛库系统,老文献常用,稳定性好
三、Y1HGold-pAbAi 系统筛库流程
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四、推荐生物试剂与耗材
类别
名称
货号
试剂盒
酵母转化试剂盒
YT0010/YT0015
培养基
SD 基础培养基
Y0006
SD液体培养基
SD/-trp with broth
Y14028101
SD/-Ura with broth
Y14028102
SD/-His with broth
Y14028103
SD/-Leu with broth
Y14028104
SD/-His-Ura with broth
Y14028201
SD/-His-Trp with broth
Y14028202
SD/-Trp-Ura with broth
Y14028206
SD/-Leu-Ura with broth
Y14028207
SD/-Met-Trp with broth
Y14028208
SD/-Leu-Trp with broth
Y14028220
SD/-His-Leu with broth
Y14028221
SD/-Ade-Trp with broth
Y14028223
YPDA 液体 / 固体培养基
BD 242820
SD固体培养基
SD/-trp with agar
Y24048101
SD/-Ura with agar
Y24048102
SD/-His with agar
Y24048103
SD/-Leu with agar
Y24048104
SD/-His-Ura with agar
Y24048201
SD/-His-Trp with agar
Y24048202
SD/-Trp-Ura with agar
Y24048206
SD/-Leu-Ura with agar
Y24048207
SD/-Met-Trp with agar
Y24048208
SD/-Leu-Trp with agar
Y24048220
SD/-His-Leu with agar
Y24048221
SD/-Ade-Trp with agar
Y24048223
添加剂
X-α-Gal
X0200
3-AT(Y187-pHis2 系统自激活抑制)
A8056-1
鲑鱼精DNA溶液10mg/ml
D1627
Salmon Sperm DNA鲑鱼精DNA
D1626
金担子素 A(AbA)
C060208