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  • DNA Assembly Mix singlePlus(无缝克隆试剂盒单片段)(货号:D0205P)
  • DNA Assembly Mix singlePlus(无缝克隆试剂盒单片段)(货号:D0205P)

    • ¥27500.00
      ¥27500.00
CAS:

货号:D0205P

存储温度 :-20°C 


产品组分

组分/规格

50T

250T

DNA Assembly Mix Single PLUS

500μ l

5 × 500ul


产品简介

基于重组原理的无缝克隆技术,作为新一代的克隆方法,不依赖繁琐的酶切、连接步骤,也不需要末端补平等操作,依 据  DNA  片段与线性化载体末端的  15~25 nt  同源序列的重组 ,可将插入片段克隆至任意载体的任意位点,载体自连背景 极低 ,是一种简单、快速、高效的 DNA 定向克隆技术。

DNA Assembly Mix Single Plus 无缝克隆试剂盒,专为单片段优化,最快仅需5 分钟即可完成单片段  重组 ,且阳性率高于95%。DNA Assembly Mix Single Plus  相较于  DNA Assembly Mix Plus (Cat:D0204P) ,不依赖连接酶,组分更简单,对未纯化的  PCR 产物兼容性更强。同时,由于不含连接酶,依靠大肠杆菌本身的修复系统,保真度更高。

 

产品应用

快速克隆;单片段  DNA 组装;DNA 定点突变。


实验步骤

1、实验流程概要

 

注 1:经双酶切进行线性化的载体无需去磷酸化,经单酶切则需要去磷酸化;

注 2:酶切完成后,应将快速内切酶失活或对目的产物纯化后再用于重组反 应。

注 3 :载体胶回收时建议长时间电泳与残留的环状质粒区分开后再切胶, 以减少假阳性率。


2. 线性化克隆载体制备

选择合适的克隆位点,对载体进行线性化,载体的线性化可以通过酶切或反向PCR扩增完成。

① 酶切制备

推荐使用 LabFD™快速内切酶进行双酶切 ,使载体线性化完全,以降低转化背景(假阳性克隆);若使用单酶切进行线性化,可以适当延长酶切时间以减少环状质粒残留。

② 反向  PCR 扩增制备

为减少扩增突变的引入,推荐使用高保真 PCR Mix 进行扩 增。推荐使用预线性化质粒作为模板 ,以减少环状质粒模板残 留对克隆阳性率的影响。

注  1 : PCR 产物无非特异性条带时 ,推荐使用 LabFD™  DpnI (  货号 : F5585S) 1  μl 加入  50  μl PCR 产物中  37℃  1 h ,80℃  20 min  消化 质粒模板即可用于重组反应;反之建议将  PCR 产物胶回收后使用。


3.  插入片段 PCR 引物设计

PCR 引物的 5'  端必须包含与其相邻片段(插入片段或载 体)末端同源的 15~25 nt(推荐 18nt)序列。假如载体为粘 性末端 ,且 3'端突出 ,则引物设计必须包含突出部分;若 5'端 突出 ,则引物设计可以包含突出部分 ,也可以不包含。

插入片段正向扩增引物:

5'—上游载体末端同源序列+酶切位点(可选) + 基因特

异性正向扩增序列—3'    插入片段反向扩增引物:

3'—基因特异性反向扩增序列+酶切位点(可选)+下游载 体末端同源序列—5'

注 1:尽量选择无重复序列且 GC 含量均匀的区域进行克隆 ,当载体克隆位 点上下游 25 nt 区域内 GC 含量为 40% ~60%时 ,重组效率最高;

注 2 :包含多个重复序列的片段无法采用无缝克隆的策略进行连接。


  

注  3 :包含多个重复序列的片段无法采用无缝克隆的策略进行连接。


4.  插入片段的  PCR 扩增

推荐使用高保真 PCR Mix( Cat:T1211)进行扩增 ,以减少扩增突变的引入。建议使用纯化后的 PCR 产物进行无缝克   隆反应,若 PCR 产物经琼脂糖凝胶电泳鉴定为特异性扩增产物, 可直接使用 ,但加样体积不应超过总反应体积的 20%。


5.  重组反应

① 于冰水浴中配置以下反应体系:

 

组分

反应体系

阴性对照 c

DNA Assembly Mix Single Plus

10  μ l

10  μ l

线性化载体 a

50 ~200 ng

50 ~100 ng

插入片段 b

10 ~200 ng

-

ddH2O

To 20  μ l

a.最适载体用量(ng) =0.02×载体碱基对数 ,即 0.03 pmol。

b.插入单片段 ,最适片段用量( ng) = 0.04×片段碱基对数。

c.阴性对照可用来确认线性化载体中是否有环状质粒残留 ,推 荐进行。

注  1 :若插入单片段长度大于载体 ,则应互换载体与插入片段用量;

注  2 :若插入片段长度小于 200 bp ,则插入片段应使用 5 倍载体用量;

注  3:若按上述公式计算得到的用量超过最低/最高值,则建议直接按最低/ 最高用量使用;

注  4 :载体片段过长、插入片段过长或片段数过多 ,克隆菌落数和阳性率 均会降低。

注 5 :单点突变按照最适载体用量加入体系。

重组反应体系配制完成后 ,用移液枪轻轻吸打混匀各组 分 ,避免产生气泡 ,切勿涡旋。

② 将反应体系置于 50℃ ,  反应 5~15min。

注  1 :推荐使用  PCR 仪等温控比较精准的仪器进行反应 ,反应时间不足 克隆效率均会降低;

注  2 : 50℃反应完成后 ,建议进行瞬时离心 ,将反应液收集至管底。

③ 将反应液离心管置于冰上冷却 ,之后进行转化或者储存于-20℃。

注  1 :-20℃储存的重组产物 ,建议在 1 周内使用。


6.  重组产物转化

取 10μ l 反应液,加入到 100μ l 感受态细胞中,缓慢吸打混匀,冰上放置 30 min。42℃热激 60 s,冰浴 5 min。加 500μl SOC 或 LB 培养基 ,37℃振荡培养 50~60 min(200 rpm)。将菌液均匀涂布在含有对应抗生素的平板上,倒置于 37℃过夜培养。

注 1 :不同感受态细胞最后的克隆阳性率会有所差别 ,推荐使用转化效 率 >108 CFU/μg 的感受态细胞;

注 2 :菌落数取决于 PCR 产物与线性化载体的数量和纯度;


7.   阳性克隆检测

挑取单菌落至 10μ l ddH2O 中混匀 ,95℃裂解 10 min   后,取 1μ l 裂解液作为模板,进行菌落 PCR 鉴定(Cat:T0214), 或将单菌落接种至抗性培养基中培养过夜后,提取质粒进行   酶切鉴定。

注  1 :菌落  PCR 时建议至少使用一条通用引物 ,避免假阳性结果;

注 2 :必要时可进一步对阳性结果进行测序鉴定。


 

 

 

 


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