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  • DNA探针生物素末端标记试剂盒(货号:E4001)
  • DNA探针生物素末端标记试剂盒(货号:E4001)

    -
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    • 试剂规格:
    • 20T
CAS:
-


产品货号:E4001

储存条件:-20℃保存,冰袋运输。Biotin-11-dUTP 请于 4℃避光保存

 

产品组分

组分

20T

40T

5× TdT buffer

200 ul

400 ul

TdT(20U/ul)

11 ul

22 ul

Biotin-11-dUTP(5μM)

100 ul

200 ul

探针标记终止液

70 ul

140 ul

退火缓冲液

300 ul

600 ul

ddH2O

0.8 ml

1.6 ml

 

1. 产品简介

DNA 探针生物素末端标记试剂盒是一款对 DNA 探针进行高效末端标记的试剂盒。试剂盒采用基因工程改造优化的TdT,可以在 DNA 片段 3' 末端标记多个生物素集团,与普通生物素标记试剂盒相比,可以大幅提升后续生物素检测反应的灵敏度。由于生物素标记于 DNA 片段的末端,不会影响该 DNA 片段与特定蛋白质或互补核酸序列的结合,因而可广泛应用于 EMSA 检测、Northern 杂交、Southern 杂交、斑点杂交和原位杂交等实验研究。

 

2. 实验步骤

2.1准备工作

取出 5×TdT buffer、Biotin-11-dUTP 和 ddH2O,解冻后置于冰上备用。

准备待标记探针

a. 单链 DNA:直接用水稀释至 1μM,置于冰上备用。

b. 双链 DNA:95℃加热 2min,迅速置于冰水浴变性为单链,再用水稀释至 1μM,置于冰上备用。

注:1μM DNA 双链质量浓度换算公式:质量浓度(ng/ul)=碱基对数×0.66。例:300bp 的 DNA 双链,摩尔浓度为 1μM,则对应的质量浓度为 300×0.66=198ng/ul。 

 

 

下表为常见 bp 长度的摩尔浓度与质量浓度换算表:

DNA 长度

1μM对应质量浓度(ng/μL)

50 bp

33

100 bp

66

500 bp

330

1000 bp(1KB)

660

3000 bp(3KB)

1980

2.2 DNA 探针标记

根据下表配制 50ul 反应体系:

组分

体积

ddH2O

29.5 ul

5× TdT buffer

10 ul

待标记探针(1μM)

5 ul

Biotin-11-dUTP

5 ul

TdT

0.5 ul

Total

50 ul

用移液器轻轻吹打混匀,切勿涡旋振荡。37℃孵育 30min。

反应结束加入 2.5ul 探针标记终止液,轻轻混匀,终止反应。

2.3 TdT 的去除(EMSA 须此步,分子杂交不须)

探针标记反应终止后,加入 52.5 µl 氯仿-异戊醇(24:1),涡旋振荡使有机相和水相充分混合,静置等待有机相和水相分层。

13,000g 离心 1-2 分钟,吸取上清备用。上清即为被生物素标记的单链 DNA 探针。

2.4 生物素标记检测(可选)

取带正电荷尼龙膜裁剪成合适大小,做好标记。用灭菌双蒸水浸泡 10min,再用 2×SSC 缓冲液浸泡 30min,室温晾干。

2μl 待测探针滴加至尼龙膜毛面,确保液滴完全吸收,在膜上形成一个圆形小斑点。

将尼龙膜放在干净的滤纸上,室温干燥 30min,再将尼龙膜放在烘箱中,120℃烘烤 30min。

使用生物素检测试剂盒(货号 EM001)检测生物素信号,检测前用 TBST 洗膜 5min。 

 

2.5 生物素标记 EMSA 探针的制备

对于步骤2.3标记好的单链 DNA 探针,把正义链和反义链等体积混合。若待标记探针为双链 DNA 探针,标记后直接进入下一步。

加入 10×退火缓冲液,使终浓度为 1×(例:100μl 探针液加 11μl 缓冲液),混匀。

退火条件:金属浴或水浴 95℃变性 2min 后,取出静置 30min 左右,直至自然冷却至室温。

退火反应结束后,-20ºC 保存标记好的 EMSA 探针。此时的 EMSA 探针已经可以直接用于后续的 EMSA 检测,也可以对探针进行适当纯化后再进行 EMSA 检测。

 

注意事项

1、本试剂盒可用于 DNA 单链探针或 DNA 双链探针的 3'末端生物素标记。推荐使用 PCR 合成的 DNA 双链作为待标记探针,避免互补链量不一致导致多余单链的形成。

2、如果使用双链 DNA 作为待标记探针,使用前需 95℃加热 2min,迅速置于冰水浴变性后再进行末端标记。标记结束后需要进行退火以形成完整的双链探针。

3、标记探针一般不需要进一步纯化,确需纯化的,建议采用乙醇沉淀法。标记探针暂不使用的,请保存于-20ºC,使用时在冰上解冻。

4、实验需自备氯仿、异戊醇、带正电荷尼龙膜及生物素检测相关试剂(推荐EMSA检测试剂盒,货号EM001)。

5、为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。


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