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  • Lab TOPO定向Gateway入门克隆构建试剂盒(货号:PG0101)
  • Lab TOPO定向Gateway入门克隆构建试剂盒(货号:PG0101)

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    • 试剂规格:
    • 20T
CAS:
-

货号:PG0101

存储条件:-20°C至少 12 个月内不影响使用效果。

产品简介:

本品采用了先进的Directional Topoisomerase Cloning(定向拓扑异构酶克隆技术)可以在5min内将待表达目的基因(高保真酶扩增的平末端片段)一步法定向克隆到Gateway入门载体(entry vector),得到的入门克隆(entry clone)可以和各种Gateway目的载体(destination vector)通过LR重组反应,生成表达克隆(expression clone)。方便目的基因在原核/哺乳动物细胞/酵母/昆虫表达系统切换表达。

产品特点:

简单快速,加入待表达基因片段室温仅需5min便可完成入门克隆构建。

定向克隆技术,超过90%插入为正确方向插入,减少克隆筛选耗费的时间。

本载体不含原核表达Shine-Dalgarno(SD)序列,构建原核表达克隆时应选择带SD序列的目的载体进行LR重组。也可在设计的时候,在目的片段前自带SD序列。

测序可以采用 M13F/M13R 通用引物测序(见后面图谱)

操作步骤:

1. 待表达目的基因扩增引物设计原则:

(1) 为了达到定向克隆的目的,上游引物 5’端应该加上额外的 4 个碱基 CACC,这样PCR 产物的 5’端可以和载体上突出的 GTGG 互补配对,从而达到定向克隆的目的。

例如:

待表达序列:5′-ATG GGA TCT GAT AAA ...

设计上游引物:5′-CACC ATG GGA TCT GAT AAA ...

(2) 如果不计划和载体 C 端融合表达,则下游引物的起始端应该加上终止密码子(密码子序列应该为反向互补序列,例如终止密码子是 TGA,那么下游引物起始为 TCA)

(3) 如计划和载体 C 端融合表达,则下游引物的起始端应该不包含终止密码子;为达到定向克隆的目的,下游引物 5’起始应该不包含 CACC,这样可以避免 PCR 产物的3’端也可以和载体上突出的 GTGG 互补配对而造成错误方向的插入。

2. 连接反应的准备:

PCR引物不能磷酸化。使用扩增产物是平末端的高保真聚合酶系列扩增(如Pfu、Vent、Kod、 Phusion DNA Polymerase)。PCR产物建议胶回收纯化。

3. 连接反应:

1) 室温(20℃-30℃)按照如下体系操作(10ul 体系):

纯化后的PCR 产物

0.5-8ul

pTOPO-ENTR/D Vector

1ul

10 ´ Enhancer

1ul

灭菌水

Xul

总体积

10ul

 加完试剂后,用移液器轻轻吹打混匀或者轻弹管底混匀,低速瞬时离心收集所有液体在离心管底,注意此步骤不能在冰上进行,只能在室温(20℃-30℃)进行。

不同大小插入片段的推荐用量:

插入片段大小(bp)

最佳用量(ng)

100-1000

20-40

1000-2000

30-70

2000-5000

40-100

2) 室温(20℃-30℃)连接 5 min。

本载体推荐室温 5min完成连接,但在很多情况下连接 2-3 min已经可以得到足够多的转化子。

3) 连接产物可直接转化克隆感受态细胞(如 DH5a,TOP10 等)或贮存于-20℃。如尚未准备好感受态细胞,可以将连接产物短时间置于冰上备用。

4. 转化:

1)50-100ul感受态细胞,置于室温解冻,完全解冻后(约1 min左右)轻掸几次将细胞均匀悬浮。

2)加入5ul连接液(最多可全部加入,只要体积不超过感受态细胞体积的 1/10),轻轻混匀室温放置 5min。

根据经验,载体使用商品化的感受态细胞不需要冰浴和热休克、室温放置 5 min便可获得足够多转化子,如果实验室自制感受态细胞或者效率较低时,可以按照标准程序进行。

 300-500ul  LB 或者 SOC 培养基(不含抗生素),37℃ 180 rpm 振荡培养 60min。一般可以直接将培养基(事先平衡至室温) 加入感受态细胞的 1.5 ml 离心管,盖上离心管盖,水平固定在振荡培养箱中振荡培养复苏即可, 不需要转移到试管培养复苏。

4)取 200ul 菌液涂板,培养过夜(如果预计转化子少,为得到较多克隆,4000 rpm 离心 1 min,吸弃掉部分上清,保留 100-150ul,轻弹悬浮菌体,取全部菌液涂板)

5.转化子的筛选鉴定:

1).菌落 PCR 检测/提取质粒内切酶酶切鉴定阳性克隆。

2).用 M13 通用引物测序,来确定是否含有目的克隆。

 pTOPO-ENTR/D 载体图谱:

pTOPO-ENTR/D 载体通用测序引

M13F: CTGTAAAACGACGGCCAG

M13R: CAGGAAACAGCTATGAC


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