货号:PG0101
存储条件:-20°C至少 12 个月内不影响使用效果。
产品简介:
本品采用了先进的Directional Topoisomerase Cloning(定向拓扑异构酶克隆技术)可以在5min内将待表达目的基因(高保真酶扩增的平末端片段)一步法定向克隆到Gateway入门载体(entry vector),得到的入门克隆(entry clone)可以和各种Gateway目的载体(destination vector)通过LR重组反应,生成表达克隆(expression clone)。方便目的基因在原核/哺乳动物细胞/酵母/昆虫表达系统切换表达。
产品特点:
简单快速,加入待表达基因片段室温仅需5min便可完成入门克隆构建。
定向克隆技术,超过90%插入为正确方向插入,减少克隆筛选耗费的时间。
本载体不含原核表达Shine-Dalgarno(SD)序列,构建原核表达克隆时应选择带SD序列的目的载体进行LR重组。也可在设计的时候,在目的片段前自带SD序列。
测序可以采用 M13F/M13R 通用引物测序(见后面图谱)
操作步骤:
1. 待表达目的基因扩增引物设计原则:
(1) 为了达到定向克隆的目的,上游引物 5’端应该加上额外的 4 个碱基 CACC,这样PCR 产物的 5’端可以和载体上突出的 GTGG 互补配对,从而达到定向克隆的目的。
例如:
待表达序列:5′-ATG GGA TCT GAT AAA ...
设计上游引物:5′-CACC ATG GGA TCT GAT AAA ...
(2) 如果不计划和载体 C 端融合表达,则下游引物的起始端应该加上终止密码子(密码子序列应该为反向互补序列,例如终止密码子是 TGA,那么下游引物起始为 TCA)
(3) 如计划和载体 C 端融合表达,则下游引物的起始端应该不包含终止密码子;为达到定向克隆的目的,下游引物 5’起始应该不包含 CACC,这样可以避免 PCR 产物的3’端也可以和载体上突出的 GTGG 互补配对而造成错误方向的插入。
2. 连接反应的准备:
PCR引物不能磷酸化。使用扩增产物是平末端的高保真聚合酶系列扩增(如Pfu、Vent、Kod、 Phusion DNA Polymerase)。PCR产物建议胶回收纯化。
3. 连接反应:
1) 室温(20℃-30℃)按照如下体系操作(10ul 体系):
纯化后的PCR 产物 | 0.5-8ul |
pTOPO-ENTR/D Vector | 1ul |
10 ´ Enhancer | 1ul |
灭菌水 | Xul |
总体积 | 10ul |
加完试剂后,用移液器轻轻吹打混匀或者轻弹管底混匀,低速瞬时离心收集所有液体在离心管底,注意此步骤不能在冰上进行,只能在室温(20℃-30℃)进行。
不同大小插入片段的推荐用量:
插入片段大小(bp) | 最佳用量(ng) |
100-1000 | 20-40 |
1000-2000 | 30-70 |
2000-5000 | 40-100 |
2) 室温(20℃-30℃)连接 5 min。
本载体推荐室温 5min完成连接,但在很多情况下连接 2-3 min已经可以得到足够多的转化子。
3) 连接产物可直接转化克隆感受态细胞(如 DH5a,TOP10 等)或贮存于-20℃。如尚未准备好感受态细胞,可以将连接产物短时间置于冰上备用。
4. 转化:
1)50-100ul感受态细胞,置于室温解冻,完全解冻后(约1 min左右)轻掸几次将细胞均匀悬浮。
2)加入5ul连接液(最多可全部加入,只要体积不超过感受态细胞体积的 1/10),轻轻混匀室温放置 5min。
根据经验,载体使用商品化的感受态细胞不需要冰浴和热休克、室温放置 5 min便可获得足够多转化子,如果实验室自制感受态细胞或者效率较低时,可以按照标准程序进行。
加 300-500ul LB 或者 SOC 培养基(不含抗生素),37℃ 180 rpm 振荡培养 60min。一般可以直接将培养基(事先平衡至室温) 加入感受态细胞的 1.5 ml 离心管,盖上离心管盖,水平固定在振荡培养箱中振荡培养复苏即可, 不需要转移到试管培养复苏。
4)取 200ul 菌液涂板,培养过夜(如果预计转化子少,为得到较多克隆,4000 rpm 离心 1 min,吸弃掉部分上清,保留 100-150ul,轻弹悬浮菌体,取全部菌液涂板)
5.转化子的筛选鉴定:
1).菌落 PCR 检测/提取质粒内切酶酶切鉴定阳性克隆。
2).用 M13 通用引物测序,来确定是否含有目的克隆。
pTOPO-ENTR/D 载体图谱:
pTOPO-ENTR/D 载体通用测序引
M13F: CTGTAAAACGACGGCCAG
M13R: CAGGAAACAGCTATGAC